32:
163:
require a begomovirus for movement in plants and insect transmission but are capable of self replication in host plants. They do not appear to cause disease in plants or to alter the course of infection by the begomovirus. They may be able to reduce the severity of an infection by the begomoviruses.
141:
in length with an adenine content of between 52.3–58.4%. Phylogenectic analysis of this region shows that they can be divided into three clades which correspond to those found on phylogenetic analysis of the entire genome. This portion of the genome appears to be redundant.
106:
The hairpin structure has a loop that includes the nonanucleotide, TAGTATTAC, which is common to nanoviruses and differs from the TAATATTAC sequence of geminiviruses by one nucleotide. In both geminiviruses and nanoviruses this sequence contains the origin of replication
80:
molecule. The first alphasatellites were described in 1999 and were associated with cotton leaf curl disease and
Ageratum yellow vein disease. As begomoviruses are being characterised at the molecular level an increasing number of alphasatellites are being described.
886:
974:
930:
801:
757:
Kumar J, Kumar A, Roy JK, Tuli R, Khan JA (August 2010). "Identification and molecular characterization of begomovirus and associated satellite DNA molecules infecting
Cyamopsis tetragonoloba".
1162:
87:
These viruses are generally found in the Old World. A number have been isolated from the New World but their association with their host viruses is still being studied.
931:"Ten distinct circular ssDNA components, four of which encode putative replication-associated proteins, are associated with the faba bean necrotic yellows virus genome"
5057:
1155:
5070:
458:"A nanovirus-like DNA component associated with yellow vein disease of Ageratum conyzoides: evidence for interfamilial recombination between plant DNA viruses"
1148:
5031:
76:) to replicate their genomes. As such, they have minimal genomes with very low genomic redundancy. The genome is a single circular single strand
145:
A putative second ORF in the genome of an alphasatellite virus has been described. The significance of this finding (if any) is not known.
1086:"Development and application of an efficient virus-induced gene silencing system in Nicotiana tabacum using geminivirus alphasatellite"
802:"An unusual alphasatellite associated with monopartite begomoviruses attenuates symptoms and reduces betasatellite accumulation"
671:
846:"Post-transcriptional gene silencing suppressor activity of two non-pathogenic alphasatellites associated with a begomovirus"
31:
95:
The genome is between 1300 and 1400 nucleotides in length and has three conserved features: a hairpin structure, a single
156:
There are no distinctive virions because the viral genomes are encapsidated within the coat protein of the helper virus.
115:
to initiate viral DNA replication. On the basis of the hairpin structures alphasatellites can be divided into 5 clades.
2948:
621:"Characterization of alphasatellites associated with monopartite begomovirus/betasatellite complexes in Yunnan, China"
196:. This family has three subfamilies, 18 genera, and 85 species. The following subfamilies and genera are recognized (-
5075:
5103:
4692:
4197:
3271:
112:
1019:"Suppressors of RNA silencing encoded by the components of the cotton leaf curl begomovirus-betasatellite complex"
672:"The function of the a-rich region of the alphasatellite associated with the cotton leaf curl disease in Pakistan"
118:
The open reading frame encodes a rolling circle replication initiator protein (Rep) similar to that found in the
1171:
318:
499:"Identification of a novel circular single-stranded DNA associated with cotton leaf curl disease in Pakistan"
209:
887:"Sequence analysis of a faba bean necrotic yellows virus DNA component containing a putative replicase gene"
267:
4971:
575:"Diversity of DNA 1: a satellite-like molecule associated with monopartite begomovirus-DNA beta complexes"
5009:
3459:
295:
3933:
346:
309:
302:
274:
216:
173:. These tend to be slightly shorter (1100–1300 nucleotides) but to encode proteins in addition to the
5098:
4510:
4032:
3227:
1506:
1175:
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1115:
1040:
999:
975:"Sequences of ten circular ssDNA components associated with the milk vetch dwarf virus genome"
955:
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2086:
1868:
1779:
1699:
1595:
538:
Stanley J (February 2004). "Subviral DNAs associated with geminivirus disease complexes".
4925:
4903:
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4836:
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1285:
1140:
786:
126:
in molecular weight with ~320 amino acids. It is highly conserved with 86.3–100.0%
73:
712:"Association of an atypical alphasatellite with a bipartite New World begomovirus"
416:
5023:
4994:
994:
950:
844:
Nawaz-Ul-Rehman MS, Nahid N, Mansoor S, Briddon RW, Fauquet CM (September 2010).
551:
383:
These viruses have been used in the development of viral gene silencing studies.
5044:
5003:
4781:
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1223:
1199:
862:
845:
591:
574:
399:
Silva, Jorge Miguel; Pratas, Diogo; Caetano, Tânia; Matos, Sérgio (2022-08-11).
169:
160:
906:
4653:
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1101:
1003:
959:
915:
4988:
800:
Idris AM, Shahid MS, Briddon RW, Khan AJ, Zhu JK, Brown JK (March 2011).
5049:
5036:
100:
375:, it is likely that the alphasatellites evolved from the nanoviruses.
4965:
1135:
973:
Sano Y, Wada M, Hashimoto Y, Matsumoto T, Kojima M (December 1998).
43:
710:
Romay G, Chirinos D, Geraud-Pouey F, Desbiez C (November 2010).
4969:
4833:
4704:
4194:
3268:
2945:
2345:
1196:
1144:
1058:
929:
Katul L, Timchenko T, Gronenborn B, Vetten HJ (December 1998).
77:
1084:
Huang CJ, Zhang T, Li FF, Zhang XY, Zhou XP (February 2011).
167:
Alphasatellites have also been described in association with
1017:
Amin I, Hussain K, Akbergenov R, et al. (August 2011).
181:
these were not initially recognised as distinct genomes.
133:
The adenine rich region is immediately downstream of the
497:
Mansoor S, Khan SH, Bashir A, et al. (June 1999).
573:
Briddon RW, Bull SE, Amin I, et al. (July 2004).
177:
gene. Because of the multiple component genome of the
84:
These viruses were earlier known as DNA 1 components.
1063:
International
Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)
184:
Alphasatellites may be the target of RNA silencing.
4978:
4913:
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1183:
192:Alphasatellites are grouped together in the family
148:Recombination occurs between alphasatellites.
72:that depend on the presence of another virus (
1156:
885:Katul L, Maiss E, Vetten HJ (February 1995).
8:
619:Xie Y, Wu P, Liu P, Gong H, Zhou X (2010).
401:"The complexity landscape of viral genomes"
4966:
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473:
432:
371:proteins of the alphasatellites and the
456:Saunders K, Stanley J (November 1999).
391:
111:) and is nicked by the rolling circle
7:
670:Shahid MS, Ali L, Andleeb S (2009).
159:Alphasatellites associated with the
130:sequence identity between isolates.
68:are a single-stranded DNA family of
367:Given the similarities between the
122:. The encoded protein is 32–37 kilo
137:gene and is approximately 153–169
14:
30:
1059:"Virus Taxonomy: 2022 Release"
1:
113:replication initiator protein
995:10.1099/0022-1317-79-12-3111
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552:10.1016/j.vetmic.2003.10.005
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