718:. HP1 can act as both an enhancer and silencer of splicing alternative exons. The exact role it plays in regulation varies by gene and is dependent on the methylation patterns within the gene body. In humans, the role of HP1 on splicing has been characterized for alternative splicing of the EDA exon from the
693:
HP1 has a versatile structure with three main components; a chromodomain, a chromoshadow domain, and a hinge domain. The chromodomain is responsible for the specific binding affinity of HP1 to histone H3 when tri-methylated at the 9th lysine residue. HP1 binding affinity to nucleosomes containing
722:
gene. In this pathway HP1 acts as a mediator protein for repression of alternative splicing of the EDA exon. When the chromatin within the gene body is not methylated, HP1 does not bind and the EDA exon is transcribed. When the chromatin is methylated, HP1 binds the chromatin and recruits the
706:
shows that experimental HP1 binding isotherms can be explained by a simple model without cooperative interactions between neighboring HP1 dimers. Nevertheless, favorable interactions between nearest neighbors of HP1 lead to limited spreading of HP1 and its marks along the nucleosome chain
752:
of 85 seconds in response to double-strand breaks. This is a bit slower than the recruitment of the very earliest proteins recruited to sites of DNA damage, though HP1 recruitment is still one of the very early steps in DNA repair. Other earlier proteins may be recruited with a
505:
activation, regulation of binding of cohesion complexes to centromeres, sequestration of genes to the nuclear periphery, transcriptional arrest, maintenance of heterochromatin integrity, gene repression at the single nucleosome level, gene repression by heterochromatization of
730:
which binds HP1 and splices the EDA exon from the mature transcript. In this mechanism HP1 recognizes the H3K9me3 methylated chromatin and recruits a splicing factor to alternatively splice the mRNA, thereby excluding the EDA exon from the mature transcript.
743:
of these damages. The presence of the HP1 protein isoforms at DNA damages assists with the recruitment of other proteins involved in subsequent DNA repair pathways. The recruitment of the HP1 isoforms to DNA damage is rapid, with half maximum recruitment
1906:
1135:
Festenstein R, Sharghi-Namini S, Fox M, Roderick K, Tolaini M, Norton T, et al. (December 1999). "Heterochromatin protein 1 modifies mammalian PEV in a dose- and chromosomal-context-dependent manner".
1899:
2828:
1088:"Human heterochromatin protein 1 isoforms HP1(Hsalpha) and HP1(Hsbeta) interfere with hTERT-telomere interactions and correlate with changes in cell growth and response to ionizing radiation"
1051:
Wreggett KA, Hill F, James PS, Hutchings A, Butcher GW, Singh PB (1994). "A mammalian homologue of
Drosophila heterochromatin protein 1 (HP1) is a component of constitutive heterochromatin".
7318:
1892:
739:
All HP1 isoforms (HP1-alpha, HP1-beta, and HP1-gamma) are recruited to DNA at sites of UV-induced damages, at oxidative damages and at DNA breaks. The HP1 protein isoforms are required for
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657:
HP1 interacts with numerous other proteins/molecules (in addition to H3K9me3) with different cellular functions in different organisms. Some of these HP1 interacting partners are:
541:, in which a yeast-specific silencing complex of SIR (silent information regulatory) proteins serve a similar function. Members of the HP1 family are characterized by an N-terminal
1438:
Teif VB, Kepper N, Yserentant K, Wedemann G, Rippe K (February 2015). "Affinity, stoichiometry and cooperativity of heterochromatin protein 1 (HP1) binding to nucleosomal arrays".
963:"Arabidopsis TERMINAL FLOWER 2 gene encodes a heterochromatin protein 1 homolog and represses both FLOWERING LOCUS T to regulate flowering time and several floral homeotic genes"
5534:
4212:
3234:
3229:
3224:
1004:"Functional mammalian homologues of the Drosophila PEV-modifier Su(var)3-9 encode centromere-associated proteins which complex with the heterochromatin component M31"
2873:
2858:
2544:
361:
212:
63:
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641:. HP1β is a dosage-dependent modifier of pericentric heterochromatin-induced silencing and silencing is thought to involve a dynamic association of the HP1β
7162:
7146:
1965:
1757:
Bártová E, Malyšková B, Komůrková D, Legartová S, Suchánková J, Krejčí J, Kozubek S (May 2017). "Function of heterochromatin protein 1 during DNA repair".
3219:
3004:
2997:
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2975:
2970:
2965:
2960:
2888:
855:"Mutation in a heterochromatin-specific chromosomal protein is associated with suppression of position-effect variegation in Drosophila melanogaster"
6884:
3683:
1387:
Lachner M, O'Carroll D, Rea S, Mechtler K, Jenuwein T (March 2001). "Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins".
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as a dimer and in principle can form multimeric complexes. Some studies have interpreted HP1 binding in terms of nearest-neighbor
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domain, separated by a hinge region. HP1 is also found at some euchromatic sites, where its binding can correlate with either
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806:"Identification of a nonhistone chromosomal protein associated with heterochromatin in Drosophila melanogaster and its gene"
619:(a plant), there is one structural homolog: Like Heterochromatin Protein 1 (LHP1), also known as Terminal Flower 2 (TFL2).
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1658:"Regulation of fibronectin EDA exon alternative splicing: possible role of RNA secondary structure for enhancer display"
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K9me3. The binding of the K9me3-modified H3 N-terminal tail by the chromodomain is a defining feature of HP1 proteins.
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histone H3 methylated at lysine K9 is significantly higher than to those with unmethylated lysine K9. HP1 binds
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2032:
502:
1336:
Verschure PJ, van der Kraan I, de Leeuw W, van der Vlag J, Carpenter AE, Belmont AS, van Driel R (June 2005).
1230:"Human origin recognition complex is essential for HP1 binding to chromatin and heterochromatin organization"
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1338:"In vivo HP1 targeting causes large-scale chromatin condensation and enhanced histone lysine methylation"
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1289:"MeCP2 interacts with HP1 and modulates its heterochromatin association during myogenic differentiation"
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914:"A sequence motif found in a Drosophila heterochromatin protein is conserved in animals and plants"
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Yearim A, Gelfman S, Shayevitch R, Melcer S, Glaich O, Mallm JP, et al. (February 2015).
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Luijsterburg MS, Dinant C, Lans H, Stap J, Wiernasz E, Lagerwerf S, et al. (May 2009).
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1614:"HP1 is involved in regulating the global impact of DNA methylation on alternative splicing"
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Sharma GG, Hwang KK, Pandita RK, Gupta A, Dhar S, Parenteau J, et al. (November 2003).
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853:
Eissenberg JC, James TC, Foster-Hartnett DM, Hartnett T, Ngan V, Elgin SC (December 1990).
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912:
Singh PB, Miller JR, Pearce J, Kothary R, Burton RD, Paro R, et al. (February 1991).
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1287:
Agarwal N, Hardt T, Brero A, Nowak D, Rothbauer U, Becker A, et al. (August 2007).
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1002:
Aagaard L, Laible G, Selenko P, Schmid M, Dorn R, Schotta G, et al. (April 1999).
714:
The binding affinity of the HP1 chromodomain has also been implicated in regulation of
1867:
1854:
Singh PB, Georgatos SD (Oct–Dec 2002). "HP1: facts, open questions, and speculation".
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1181:"Heterochromatin protein 1 (HP1): interactions with itself and chromatin components"
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Muro AF, Caputi M, Pariyarath R, Pagani F, Buratti E, Baralle FE (April 1999).
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Proceedings of the
National Academy of Sciences of the United States of America
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Proceedings of the
National Academy of Sciences of the United States of America
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Proceedings of the
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702:. However, the analysis of available data on HP1 binding to nucleosomal arrays
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of HP1 are found in
Drosophila melanogaster, HP1a, HP1b and HP1c. Subsequently
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Hathaway NA, Bell O, Hodges C, Miller EL, Neel DS, Crabtree GR (June 2012).
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or gene activation. HP1 was originally discovered by
Tharappel C James and
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2017:
2000:
1995:
1990:
1985:
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92:
7057:
6386:
4628:
3128:
1930:
1888:
961:
Kotake T, Takada S, Nakahigashi K, Ohto M, Goto K (June 2003).
6928:
6557:
6547:
6427:
5823:
5380:
4729:
4180:
3917:
3411:
2883:
2712:
2702:
2697:
2489:
2484:
599:(Pdd1p) and many other metazoans. In mammals, there are three
1501:"Dynamics of inherently bounded histone modification domains"
1228:
Prasanth SG, Shen Z, Prasanth KV, Stillman B (August 2010).
761:
of about 1 second in response to double-strand breaks (see
485:) ("Chromobox Homolog", CBX) consists of highly conserved
1560:"Dynamics and memory of heterochromatin in living cells"
1707:"The emerging role of HP1 in the DNA damage response"
7176:
7136:
7105:
7070:
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6972:
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5807:
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98:
86:
74:
62:
54:
44:
39:
32:
748:) by 180 seconds in response to UV damage, and a t
557:in 1986 as a factor in the phenomenon known as
7319:transcription factor/coregulator deficiencies
6390:β-Scaffold factors with minor groove contacts
1900:
8:
1705:Dinant C, Luijsterburg MS (December 2009).
7067:
7054:
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1353:
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1253:
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1111:
1027:
978:
937:
888:
878:
829:
489:, which have important functions in the
796:
327:
178:
29:
1651:
1649:
1607:
1605:
1603:
1499:Hodges C, Crabtree GR (August 2012).
7:
1440:Journal of Physics: Condensed Matter
804:James TC, Elgin SC (November 1986).
3073:(1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
757:of 40 seconds for UV damage and a t
522:packaging that are enriched at the
689:Binding affinity and cooperativity
25:
1355:10.1128/mcb.25.11.4552-4564.2005
1104:10.1128/MCB.23.22.8363-8376.2003
679:methyl CpG binding protein MeCP2
7060:(0) Other transcription factors
6344:transcriptional enhancer factor
1961:Activating transcription factor
583:of HP1 were also discovered in
1711:Molecular and Cellular Biology
1662:Molecular and Cellular Biology
1342:Molecular and Cellular Biology
1179:Kumar A, Kono H (April 2020).
1092:Molecular and Cellular Biology
1053:Cytogenetics and Cell Genetics
810:Molecular and Cellular Biology
537:with the notable exception of
1:
6274:Interferon regulatory factors
4513:(2.5) Alternating composition
3709:General transcription factors
1868:10.1016/S1047-8477(02)00536-1
1856:Journal of Structural Biology
1470:10.1088/0953-8984/27/6/064110
7344:Genes on human chromosome 17
7339:Genes on human chromosome 12
5559:Octamer transcription factor
2267:(1.2) Basic helix-loop-helix
1631:10.1016/j.celrep.2015.01.038
7349:Genes on human chromosome 7
2333:Myogenic regulatory factors
1806:The Journal of Cell Biology
967:Plant & Cell Physiology
559:position effect variegation
7375:
1576:10.1016/j.cell.2012.03.052
1197:10.1007/s12551-020-00663-y
683:origin recognition complex
626:
595:(CHCB1, CHCB2 and CHCB3),
493:. These functions include
7314:
7066:
7053:
6396:
6382:
6153:(3.5) Tryptophan clusters
4643:
4624:
3141:
3124:
1939:
1926:
1771:10.1007/s00709-017-1090-3
671:histone methyltransferase
635:histone methyltransferase
518:are fundamental units of
479:heterochromatin protein 1
442:
293:
144:
18:Heterochromatin Protein 1
6974:(4.10) Cold-shock domain
645:with the tri-methylated
633:HP1β interacts with the
1920:intracellular receptors
1526:10.1073/pnas.1211172109
1255:10.1073/pnas.1009945107
1020:10.1093/emboj/18.7.1923
880:10.1073/pnas.87.24.9923
564:Drosophila melanogaster
1293:Nucleic Acids Research
918:Nucleic Acids Research
571:Paralogs and orthologs
7354:Transcription factors
6683:TATA-binding proteins
1916:Transcription factors
1818:10.1083/jcb.200810035
1674:10.1128/MCB.19.4.2657
822:10.1128/mcb.6.11.3862
675:DNA methyltransferase
1723:10.1128/MCB.01048-09
930:10.1093/nar/19.4.789
716:alternative splicing
653:Interacting proteins
617:Arabidopsis thaliana
7178:(0.6) Miscellaneous
6709:High-mobility group
6405:Rel homology region
3395:Testicular receptor
3136:DNA-binding domains
1517:2012PNAS..10913296H
1462:2015JPCM...27f4110T
1401:2001Natur.410..116L
1246:2010PNAS..10715093P
1185:Biophysical Reviews
871:1990PNAS...87.9923E
763:DNA damage response
700:cooperative binding
591:(Xhp1α and Xhp1γ),
332:chromobox homolog 3
183:chromobox homolog 1
34:chromobox homolog 5
6543:p53 p63 p73 family
6116:Heat shock factors
1305:10.1093/nar/gkm599
980:10.1093/pcp/pcg091
735:Role in DNA repair
7326:
7325:
7310:
7309:
7306:
7305:
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4615:
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3607:
3464:Mineralocorticoid
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3115:
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2819:
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1065:10.1159/000133676
545:and a C-terminal
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474:
471:
470:
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325:
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321:
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176:
173:
172:
16:(Redirected from
7366:
7150:-related factors
7068:
7055:
6956:(4.9) Grainyhead
6398:
6384:
6336:(3.6) TEA domain
5626:(3.2) Paired box
5267:
5001:
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4683:
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4634:Helix-turn-helix
4626:
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3568:
3543:
3506:
3476:Estrogen related
3425:
3321:
3169:
3162:
3150:Nuclear receptor
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1083:
1077:
1076:
1048:
1042:
1041:
1031:
1008:The EMBO Journal
999:
993:
992:
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958:
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951:
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902:
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850:
844:
843:
833:
801:
575:Three different
444:
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146:
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21:
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4486:
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3697:
3688:
3617:
3614:(2.2) Other Cys
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3432:Steroid hormone
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3317:
3312:
3176:Thyroid hormone
3165:
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3012:
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2796:
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2652:
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