29:
421:
structure (see figure to the right). The WD40 domain is composed of several repeats, a variable region of around 20 residues at the beginning followed by a more common repeated set of residues. These repeats typically form a four stranded anti-parallel beta sheet or blade. These blades come together
478:
According to the initial analysis of the human genome WD40 repeats are the eighth largest family of proteins. In all 277 proteins were identified to contain them. Human genes encoding proteins containing this domain include:
422:
to form a propeller with the most common being a 7 bladed beta propeller. The blades interlock so that the last beta strand of one repeat forms with the first three of the next repeat to form the 3D blade structure.
2272:
3550:
184:
2822:
454:. The underlying common function of all WD40-repeat proteins is coordinating multi-protein complex assemblies, where the repeating units serve as a rigid
458:
for protein interactions. The specificity of the proteins is determined by the sequences outside the repeats themselves. Examples of such complexes are
3761:
3958:
3612:
120:
3543:
4008:
3953:
1036:
3519:
3510:
3501:
3492:
3483:
3474:
3465:
3456:
3447:
3438:
3429:
3420:
3411:
3402:
3393:
3384:
3375:
4100:
3968:
3536:
1741:
3138:
Neer EJ, Schmidt CJ, Nambudripad R, Smith TF (September 1994). "The ancient regulatory-protein family of WD-repeat proteins".
3876:
204:
3831:
3754:
463:
4020:
439:
2149:
140:
3747:
3647:
417:
WD40 domain-containing proteins have 4 to 16 repeating units, all of which are thought to form a circularised
192:
3238:"WD-repeat proteins: structure characteristics, biological function, and their involvement in human diseases"
3728:
3588:
2685:
402:
3662:
3559:
3059:
2572:
2131:
1875:
1734:
398:
37:
3911:
3329:
3293:
Stirnimann CU, Petsalaki E, Russell RB, Müller CW (May 2010). "WD40 proteins propel cellular networks".
188:
3147:
133:
2051:
145:
3993:
3642:
3637:
467:
435:
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3978:
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3171:
4055:
3676:
3652:
3354:
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3267:
3215:
3163:
3120:
3079:
1752:
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179:
28:
2597:
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3607:
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3302:
3257:
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3155:
3110:
3102:
3028:
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2563:
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2075:
2026:
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1725:
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1534:
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1056:
1048:
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800:
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613:
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2905:
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2102:
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1406:
1402:
1394:
1390:
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1366:
1362:
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1334:
1314:
1302:
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1278:
1270:
1258:
1246:
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1214:
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1190:
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1110:
1052:
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870:
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2631:
1674:
1550:
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1186:
1150:
1114:
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894:
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679:
675:
653:
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3442:
3433:
3262:
3237:
3151:
3983:
3846:
3770:
3681:
3602:
3597:
3578:
3469:
3415:
3406:
3379:
3048:
2491:
2424:
2113:
1879:
418:
41:
33:
3505:
3496:
3460:
3451:
3210:
3193:
3115:
3090:
4094:
3916:
3617:
3091:"Structure of the C-terminal domain of Tup1, a corepressor of transcription in yeast"
659:
394:
125:
3279:
76:
3998:
3921:
3906:
3866:
3801:
3712:
2524:
167:
3487:
3478:
3175:
89:
4086:
3424:
101:
4065:
3973:
3963:
3943:
3938:
3933:
3896:
3851:
3826:
3811:
3806:
3791:
3686:
3671:
3632:
3573:
3523:
3397:
952:
617:
567:
529:
487:
483:
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3106:
4040:
4035:
4030:
4015:
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3886:
3881:
3871:
3841:
3836:
3821:
3816:
3796:
3786:
3691:
3622:
443:
390:
386:
49:
45:
4025:
3948:
3861:
3856:
3781:
459:
451:
447:
431:
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3314:
3271:
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3167:
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932:
96:
3253:
3053:
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972:
968:
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960:
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355:
349:
343:
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331:
325:
319:
313:
307:
301:
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289:
283:
277:
271:
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253:
247:
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235:
229:
223:
217:
3349:
3159:
3012:
2782:
1936:
1602:
1556:
1084:
1044:
984:
948:
898:
834:
830:
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804:
776:
756:
740:
705:
701:
587:
583:
579:
575:
563:
555:
507:
503:
495:
199:
2823:
cerebellar ataxia, mental retardation, and dysequilibrium syndrome-2
3739:
2950:
2844:
2751:
2721:
2674:
2661:
2610:
2513:
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2415:
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2342:
2295:
2280:
2261:
2246:
2187:
2156:
2138:
2087:
1979:
1949:
1849:
1808:
1792:
1759:
1709:
1542:
1522:
1482:
1474:
1462:
1446:
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1386:
1358:
1354:
1350:
1310:
1306:
1294:
1274:
1266:
1262:
1238:
1222:
1218:
1206:
1198:
1176:
1172:
1158:
1102:
1098:
1080:
1076:
1068:
1040:
1022:
1018:
1014:
1010:
1006:
988:
956:
928:
918:
914:
902:
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866:
862:
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844:
812:
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772:
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625:
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525:
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1630:
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1282:
1210:
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1142:
1138:
1134:
1122:
1118:
1094:
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1060:
1030:
1002:
996:
992:
980:
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874:
858:
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768:
764:
760:
752:
744:
733:
683:
671:
667:
609:
533:
517:
491:
161:
83:
71:
3743:
3532:
3194:"The WD40 repeat: a common architecture for diverse functions"
641:
3328:
Lander ES, Linton LM, Birren B, et al. (February 2001).
1869:
ATD5; CED4; DYF-2; ORF26; Oseg6; PWDMP; SRTD5; IFT144; NPHP13
3089:
Sprague ER, Redd MJ, Johnson AD, Wolberger C (June 2000).
434:
and are implicated in a variety of functions ranging from
2834:
SWD2; MST107; WDR82A; MSTP107; PRO2730; TMEM113; PRO34047
36:
of the C-terminal WD40 domain of Tup1 (a transcriptional
4077:
This article incorporates text from the public domain
3330:"Initial sequencing and analysis of the human genome"
3192:
Smith TF, Gaitatzes C, Saxena K, Neer EJ (May 1999).
430:
WD40-repeat proteins are a large family found in all
3721:
3705:
3661:
3587:
3566:
2273:
Beta-propeller protein-associated neurodegeneration
401:typically fold together to form a type of circular
210:
198:
178:
160:
155:
139:
119:
107:
95:
82:
70:
62:
57:
21:
2756:p44; MEP50; MEP-50; HKMT1069; Nbla10071; p44/Mep50
2955:C16orf15; C16orf16; C16orf17; C16orf18; C16orf19
16:Short protein motif that forms a solenoid domain
3231:
3229:
3187:
3185:
3755:
3544:
8:
3762:
3748:
3740:
3551:
3537:
3529:
152:
27:
3348:
3261:
3209:
3114:
1579:Human disease associated with mutations
1563:Human WDR genes and associated diseases
1561:
3071:
2266:JM5; NBIA4; NBIA5; WDRX1; WIPI4; WIPI-4
18:
3613:Transcription activator-like effector
7:
462:(beta subunit is a beta-propeller),
44:fold. Ribbon is colored from blue (
1679:TRAG; KIAA0541; Rabconnectin 3 beta
40:in yeast), which adopts a 7-bladed
14:
3236:Li D, Roberts R (December 2001).
2439:; SPF38; PRP8BP; HPRP8BP; PRPF8BP
3520:Eukaryotic Linear Motif resource
3511:Eukaryotic Linear Motif resource
3502:Eukaryotic Linear Motif resource
3493:Eukaryotic Linear Motif resource
3484:Eukaryotic Linear Motif resource
3475:Eukaryotic Linear Motif resource
3466:Eukaryotic Linear Motif resource
3457:Eukaryotic Linear Motif resource
3448:Eukaryotic Linear Motif resource
3439:Eukaryotic Linear Motif resource
3430:Eukaryotic Linear Motif resource
3421:Eukaryotic Linear Motif resource
3412:Eukaryotic Linear Motif resource
3403:Eukaryotic Linear Motif resource
3394:Eukaryotic Linear Motif resource
3385:Eukaryotic Linear Motif resource
3376:Eukaryotic Linear Motif resource
1728:; CED; SPG; CED1; WDR10p; WDR140
2045:; IBD10; APG16L; ATG16A; ATG16L
399:Tandem copies of these repeats
1:
3211:10.1016/S0968-0004(99)01384-5
2143:GLC1G; UTP21; TAWDRP; TA-WDRP
156:Available protein structures:
3056:, a protein two WD40 domains
2285:UTP7; BING4; FP221; C6orf11
2150:Primary Open Angle Glaucoma
1795:; GY2; FKSG1; WDVCF; DGCRK3
4117:
4076:
3307:10.1016/j.tibs.2010.04.003
2125:CED2; IFTA1; SRTD7; IFT121
466:transcription factor, and
3777:
389:, often terminating in a
151:
26:
3648:Tetratricopeptide repeat
3107:10.1093/emboj/19.12.3016
2206:; CT102; TCC52; KIAA1892
1746:DR11; HH14; BRWD2; WDR15
440:transcription regulation
22:WD domain, G-beta repeat
3729:Repeated sequence (DNA)
2686:Amelogenesis imperfecta
2013:GRWD1; CDW4; GRWD; RRB1
403:solenoid protein domain
4101:Protein tandem repeats
3560:Protein tandem repeats
3060:Protein tandem repeats
2573:Van der Woude syndrome
2132:Sensenbrenner syndrome
1876:Sensenbrenner syndrome
1735:Sensenbrenner syndrome
1589:AIP1; NORI-1; HEL-S-52
379:beta-transducin repeat
2618:; AN11; HAN11; SWAN-1
2485:SRPS6; SRTD8; FAP163
2107:DIC5; FAP133; SRTD11
385:of approximately 40
3643:Pentapeptide repeat
3638:Leucine-rich repeat
3295:Trends Biochem. Sci
3242:Cell. Mol. Life Sci
3198:Trends Biochem. Sci
3152:1994Natur.371..297N
1650:SWD3; BIG-3; CFAP89
1564:
468:E3 ubiquitin ligase
436:signal transduction
373:(also known as the
3706:Beads-on-a-string:
3628:Antifreeze protein
3254:10.1007/PL00000838
2940:MSTP050; C14orf150
1562:
397:(W-D) dipeptide.
4074:
4073:
3737:
3736:
3677:Beta trefoil fold
3653:Trefoil knot fold
3515:TRG_Golgi_diPhe_1
3389:LIG_APCC_KENbox_2
3343:(6822): 860–921.
3146:(6495): 297–300.
3040:
3039:
2300:NEMITIN; KIAA0893
1753:Kallmann syndrome
1712:; N143; C21orf107
367:
366:
363:
362:
205:structure summary
4108:
3764:
3757:
3750:
3741:
3608:Armadillo repeat
3553:
3546:
3539:
3530:
3443:LIG_RAPTOR_TOS_1
3434:LIG_GLEBS_BUB3_1
3363:
3362:
3352:
3350:10.1038/35057062
3334:
3325:
3319:
3318:
3290:
3284:
3283:
3265:
3233:
3224:
3223:
3213:
3189:
3180:
3179:
3160:10.1038/371297a0
3135:
3129:
3128:
3118:
3086:
3076:
2881:; RRT2; C9orf112
2816:CAMRQ2; PPP1R166
2315:P80; UAF1; SPG60
1984:CDW2; GID7; MIP2
1939:; GL014; PRO2389
1571:other gene names
1565:
383:structural motif
358:
352:
346:
340:
334:
328:
322:
316:
310:
304:
298:
292:
286:
280:
274:
268:
262:
256:
250:
244:
238:
232:
226:
220:
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