37:
191:
In 2020, Yamada et al. analyzed the fundamental morphological properties of the new genera, including the cell diameter, cell length, cell perimeter, cell circularity and aspect ratio, and determined that there were significant differences between the five genera, thus supporting the new division.
241:
and iron uptake. Most species are saprophytic and are able to process decaying organic matter for nutrients. While members of this genus are not considered to be pathogenic, some species have been reported to cause infections and diseases. The genome size for
179:
in 2018 by Gupta et al. based on evidence from various phylogenetic trees constructed based on conserved genome sequences, comparative genomic analyses and average amino acid identity values. In addition to this genus, the study proposed the division of
3275:
Tortoli, Enrico; Brown-Elliott, Barbara A.; Chalmers, James D.; Cirillo, Daniela M.; Daley, Charles L.; Emler, Stefan; Floto, R. Andres; Garcia, Maria J.; Hoefsloot, Wouter; Koh, Won-Jung; Lange, Christoph (2019-07-01).
266:
270:
3473:
3405:
3333:
Yamada, Hiroyuki; Chikamatsu, Kinuyo; Aono, Akio; Murata, Kazuyoshi; Miyazaki, Naoyuki; Kayama, Yoko; Bhatt, Apoorva; Fujiwara, Nagatoshi; Maeda, Shinji; Mitarai, Satoshi (2020).
233:
is a genus of rapidly-growing bacteria, taking less than seven days to form colonies. Members are also non-chromogenic (does not produce pigment), and are positive for the 3 day
3486:
184:
into a total of five distinct genera, which was met with some resistance by some of the scientific community. The resistance was based on the grounds that
3460:
261:(CSIs) were identified through genomic analyses as uniquely present in this genus in the following proteins: LacI family transcriptional regulator,
3335:"Fundamental Cell Morphologies Examined With Cryo-TEM of the Species in the Novel Five Genera Robustly Correlate With New Classification in Family
2321:
1165:
36:
2541:
3109:
2561:
1472:
188:
contains some clinically relevant species and name changes might cause confusion among clinicians and other researchers.
3150:
2411:
2301:
1371:
2969:
2747:
2341:
2291:
2096:
2849:
2767:
2431:
2241:
1759:
715:
501:
2909:
2869:
2798:
1707:
1205:
3491:
2989:
2777:
2521:
2391:
2381:
2331:
1690:
1659:
1034:
960:
674:
281:
and all other bacteria. Additionally, 10 unique conserved signature proteins (CSPs) were identified for this genus.
3049:
3029:
2819:
2809:
2757:
2727:
2665:
2471:
2441:
2361:
2281:
2013:
1619:
1512:
920:
903:
698:
413:
373:
356:
258:
2919:
2737:
2707:
2675:
2655:
2635:
2531:
2501:
2451:
2261:
2220:
2037:
1817:
1602:
1010:
977:
444:
3171:
3119:
3099:
3079:
3039:
2999:
2959:
2939:
2787:
2615:
2551:
2421:
2351:
2271:
1955:
1536:
1455:
1323:
836:
793:
632:
461:
119:
3161:
3059:
2979:
2949:
2859:
2839:
2717:
2685:
2604:
2461:
2113:
1272:
1051:
615:
591:
542:
3532:
3129:
3089:
3069:
3019:
2899:
2879:
2696:
2645:
2491:
2481:
1938:
1834:
1741:
1553:
1347:
525:
3139:
2889:
2829:
2625:
2592:
2581:
2571:
2511:
2401:
2371:
2054:
1222:
1148:
818:
3009:
2929:
1860:
1388:
2311:
2251:
1255:
3428:
2231:
150:
3527:
2162:
3315:
207:
from the Greek noun "bacteria" (translates to small rod). Together the name refers to a genus of
31:
3499:
3378:
3360:
3307:
3299:
3257:
3239:
238:
3504:
3368:
3350:
3289:
3247:
3229:
158:
153:
88:
163:
78:
3373:
3334:
3252:
3209:
58:
3210:"Phylogenomics and Comparative Genomic Studies Robustly Support Division of the Genus
3521:
3319:
2157:
234:
175:
68:
273:. These CSIs serve as a reliable molecular means for distinguishing members of this
3277:
247:
208:
111:
3451:
3294:
3478:
3397:
3355:
3364:
3303:
3243:
3234:
3382:
3311:
3261:
3445:
48:
3465:
262:
3422:
251:
3278:"Same meat, different gravy: Ignore the new names of mycobacteria"
267:
CDP-diacylglycerol–glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase
3426:
3406:
List of
Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
2199:
Not all species are included in this phylogenetic tree.
3208:
Gupta, Radhey S.; Lo, Brian; Son, Jeen (2018-02-13).
215:
Biochemical characteristics and molecular signatures
3435:
271:
CDP-diacylglycerol–serine O-phosphatidyltransferase
203:(translates to mycolic acid) and the Latin noun
2586:(Stanford and Gunthorpe 1971) Gupta et al. 2018
2496:(Stanford and Gunthorpe 1971) Gupta et al. 2018
2884:(Tsukamura and Mizuno 1981) Gupta et al. 2018
2516:(Lévy-Frébault et al. 1983) Gupta et al. 2018
2336:(Brown-Elliott et al. 2012) Gupta et al. 2018
8:
2964:(Padgitt and Moshier 1987) Gupta et al. 2018
2934:(Lehmann and Neumann 1899) Gupta et al. 2018
3144:(Bönicke and Juhasz 1964) Gupta et al. 2018
2924:(Kusunoki and Ezaki 1992) Gupta et al. 2018
3423:
2894:(Ramaprasad et al. 2016) Gupta et al. 2018
2416:(Apajalahti et al. 1986) Gupta et al. 2018
20:
3372:
3354:
3293:
3251:
3233:
3166:(van Ingen et al. 2009) Gupta et al. 2018
3024:(Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
3014:(Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
2984:(Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018
2954:(Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018
2904:(Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
2814:(Tsukamura et al. 1986) Gupta et al. 2018
2712:(Kazda and MĂĽller 1979) Gupta et al. 2018
2650:(Kleespies et al. 1996) Gupta et al. 2018
2576:(Casal and Calero 1974) Gupta et al. 2018
2566:(Willumsen et al. 2001) Gupta et al. 2018
2476:(Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018
2466:(Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
2446:(Kirschner et al. 1992) Gupta et al. 2018
2326:(Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018
2296:(Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
3064:(Schinsky et al. 2000) Gupta et al. 2018
2974:(Trujillo et al. 2004) Gupta et al. 2018
2944:(Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018
2854:(Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018
2824:(Springer et al. 1995) Gupta et al. 2018
2762:(Domenech et al. 1997) Gupta et al. 2018
2670:(Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018
2640:(Balcázar et al. 2014) Gupta et al. 2018
2620:(Schröder et al. 1997) Gupta et al. 2018
2546:(Hormisch et al. 2006) Gupta et al. 2018
2436:(Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018
2396:(Shahraki et al. 2015) Gupta et al. 2018
2366:(Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018
2356:(Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018
2306:(Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018
3187:
3134:(Tortoli et al. 1999) Gupta et al. 2018
2874:(Shojaei et al. 1997) Gupta et al. 2018
2792:(Reischl et al. 2006) Gupta et al. 2018
2690:(Shojaei et al. 2013) Gupta et al. 2018
2680:(Tortoli et al. 2009) Gupta et al. 2018
2660:(Richter et al. 2002) Gupta et al. 2018
2536:(Bojalil et al. 1962) Gupta et al. 2018
2506:(Shojaei et al. 2000) Gupta et al. 2018
2486:(Tortoli et al. 2001) Gupta et al. 2018
2456:(Cooksey et al. 2004) Gupta et al. 2018
2386:(Jiménez et al. 2004) Gupta et al. 2018
2192:
1372:Mycolicibacterium chlorophenolicum
3034:(Tran and Dahl 2016) Gupta et al. 2018
2834:(Vuorio et al. 1999) Gupta et al. 2018
2804:(Konjek et al. 2016) Gupta et al. 2018
2742:(Konjek et al. 2016) Gupta et al. 2018
2732:(Gomila et al. 2008) Gupta et al. 2018
2630:(Tran and Dahl 2016) Gupta et al. 2018
2556:(da Costa Cruz 1938) Gupta et al. 2018
2376:(Luquin et al. 1993) Gupta et al. 2018
2286:(Konjek et al. 2016) Gupta et al. 2018
2256:(Ausina et al. 1992) Gupta et al. 2018
173:were demarcated from the larger genus
125:(da Costa Cruz 1938) Gupta et al. 2018
3176:(Brown et al. 1999) Gupta et al. 2018
3044:(Zhang et al. 2013) Gupta et al. 2018
2772:(Gcebe et al. 2017) Gupta et al. 2018
2752:(Kazda et al. 1992) Gupta et al. 2018
2722:(Zhang et al. 2012) Gupta et al. 2018
2702:(Gcebe et al. 2018) Gupta et al. 2018
2598:(Brown et al. 1999) Gupta et al. 2018
2276:(Zhang et al. 2013) Gupta et al. 2018
1760:Mycolicibacterium malmesburyense
716:Mycolicibacterium conceptionense
7:
3203:
3201:
3199:
3197:
3195:
3193:
3191:
3074:(Lamy et al. 2008) Gupta et al. 2018
2994:(Derz et al. 2004) Gupta et al. 2018
3054:(Chamoiseau 1973) Gupta et al. 2018
2526:(Chamoiseau 1973) Gupta et al. 2018
2266:(Kim et al. 2015) Gupta et al. 2018
2088:
2029:
2005:
1998:
1930:
1809:
1802:
1732:
1682:
1675:
1651:
1644:
1594:
1587:
1528:
1504:
1497:
1473:Mycolicibacterium thermoresistibile
1447:
1440:
1363:
1339:
1315:
1247:
1197:
1190:
1140:
1133:
1126:
1119:
1112:
1026:
1002:
952:
945:
895:
888:
809:
785:
690:
666:
607:
583:
576:
517:
493:
486:
436:
429:
405:
398:
348:
341:
334:
327:
320:
308:
301:
3124:(Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
3114:(Tsukamura 1966) Gupta et al. 2018
3004:(Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
2914:(Tsukamura 1966) Gupta et al. 2018
2844:(Tsukamura 1972) Gupta et al. 2018
2426:(Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
2406:(Tsukamura 1967) Gupta et al. 2018
2316:(Tsukamura 1966) Gupta et al. 2018
2246:(Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
2236:(Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
2213:comprises the followings species:
357:Mycolicibacterium mageritense
246:is between 3.95–8.0 Mbp and their
14:
3084:(Trevisan 1889) Gupta et al. 2018
2097:Mycolicibacterium aromaticivorans
1166:Mycolicibacterium austroafricanum
502:Mycolicibacterium neworleansense
277:from other genera in the family
211:containing rod-shaped bacteria.
35:
1708:Mycolicibacterium novocastrense
1206:Mycolicibacterium parafortuitum
3094:(Kazda 1980) Gupta et al. 2018
1691:Mycolicibacterium acapulcensis
1660:Mycolicibacterium celeriflavum
1035:Mycolicibacterium bacteremicum
961:Mycolicibacterium canariasense
675:Mycolicibacterium farcinogenes
1:
2014:Mycolicibacterium confluentis
1620:Mycolicibacterium holstaticum
1513:Mycolicibacterium moriokaense
921:Mycolicibacterium llatzerense
904:Mycolicibacterium mucogenicum
699:Mycolicibacterium senegalense
414:Mycolicibacterium houstonense
374:Mycolicibacterium brisbanense
3282:European Respiratory Journal
2038:Mycolicibacterium insubricum
1818:Mycolicibacterium flavescens
1603:Mycolicibacterium elephantis
1011:Mycolicibacterium diemhoferi
978:Mycolicibacterium cosmeticum
445:Mycolicibacterium peregrinum
3295:10.1183/13993003.00795-2019
1956:Mycolicibacterium monacense
1537:Mycolicibacterium rhodesiae
1456:Mycolicibacterium hassiacum
1324:Mycolicibacterium chubuense
837:Mycolicibacterium smegmatis
794:Mycolicibacterium wolinksyi
633:Mycolicibacterium boenickei
462:Mycolicibacterium fortuitum
120:Mycolicibacterium fortuitum
3549:
3156:Cortes-Albayay et al. 2021
2114:Mycolicibacterium litorale
1273:Mycolicibacterium iranicum
1052:Mycolicibacterium neoaurum
616:Mycolicibacterium vulneris
592:Mycolicibacterium porcinum
543:Mycolicibacterium septicum
259:conserved signature indels
199:is derived from the Latin
3356:10.3389/fmicb.2020.562395
3343:Frontiers in Microbiology
3222:Frontiers in Microbiology
2154:
2110:
2093:
2086:
2051:
2034:
2027:
2010:
2003:
1996:
1952:
1939:Mycolicibacterium doricum
1935:
1928:
1857:
1835:Mycolicibacterium rutilum
1831:
1814:
1807:
1800:
1756:
1742:Mycolicibacterium komanii
1737:
1730:
1704:
1687:
1680:
1673:
1656:
1649:
1642:
1616:
1599:
1592:
1585:
1554:Mycolicibacterium tusciae
1550:
1533:
1526:
1509:
1502:
1495:
1469:
1452:
1445:
1438:
1385:
1368:
1361:
1348:Mycolicibacterium obuense
1344:
1337:
1320:
1313:
1269:
1252:
1245:
1219:
1202:
1195:
1188:
1162:
1145:
1138:
1131:
1124:
1117:
1110:
1048:
1031:
1024:
1007:
1000:
974:
957:
950:
943:
917:
900:
893:
886:
833:
814:
807:
790:
783:
712:
695:
688:
671:
664:
629:
612:
605:
588:
581:
574:
539:
526:Mycolicibacterium setense
522:
515:
498:
491:
484:
458:
441:
434:
427:
410:
403:
396:
370:
353:
346:
339:
332:
325:
318:
306:
135:
130:
117:
110:
32:Scientific classification
30:
23:
3235:10.3389/fmicb.2018.00067
2055:Mycolicibacterium fallax
1223:Mycolicibacterium gilvum
1149:Mycolicibacterium vaccae
819:Mycolicibacterium goodii
1861:Mycolicibacterium phlei
1389:Mycolicibacterium rufum
1256:Mycolicibacterium aurum
3218:and Four Novel Genera"
3214:into an Emended Genus
3396:Euzéby JP, Parte AC.
2542:M. fluoranthenivorans
250:is between 65.4–70.3
3110:M. thermoresistibile
2562:M. frederiksbergense
3151:M. vinylchloridicum
3104:Nouioui et al. 2019
2412:M. chlorophenolicum
154:rod-shaped bacteria
2970:M. psychrotolerans
2748:M. madagascariense
2342:M. baixiangningiae
2322:M. austroafricanum
2292:M. aromaticivorans
3515:
3514:
3500:Open Tree of Life
3479:mycolicibacterium
3437:Mycolicibacterium
3429:Taxon identifiers
3400:Mycolicibacterium
3177:
3167:
3157:
3145:
3135:
3125:
3115:
3105:
3095:
3085:
3075:
3065:
3055:
3045:
3035:
3025:
3015:
3005:
2995:
2985:
2975:
2965:
2955:
2945:
2935:
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