1072:
in the cells. The defects were increased cell proliferation, cellular invasion of local stroma, loss of cellular polarity, and loss of E-cadherin cellular adhesion molecules. These observations suggest that SIM2s is essential for proper mammary gland development. Experiments reintroducing SIM2s in human breast cancer cells allowed for the tumor suppressive characteristics to be observed. Comparing normal human breast cells to human breast cancer cells with immunohistochemical staining showed that SIM2s was expressed more in the normal than the cancerous. Reintroducing SIM2s expression in breast cancer cells showed a decrease in growth, proliferation, and invasiveness. SIM2s represses the actions of the matrix metalloprotease-3 gene (MMP3) which include cell migration, cancer progression, and epithelial to mesenchymal transitions (EMT). SIM2s also represses the SLUG transcription factor which in turn suppresses EMT. EMT suppression allows for E-cadherin to remain and for the cell to not undergo pathological EMT associated with tumor formation. These actions show the tumor suppressive effects of SIM2s in mammary epithelium.
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11 of SIM2. It has been researched that SIM2s acts in mammary gland development and has tumor suppressive characteristics specifically in breast cancer. In a mouse specimen, when SIM2s was not expressed in mammary epithelial cells there were development defects leading to cancer-like characteristics
1822:
Fan CM, Kuwana E, Bulfone A, Fletcher CF, Copeland NG, Jenkins NA, et al. (January 1996). "Expression patterns of two murine homologs of
Drosophila single-minded suggest possible roles in embryonic patterning and in the pathogenesis of Down syndrome".
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Yamaki A, Noda S, Kudoh J, Shindoh N, Maeda H, Minoshima S, et al. (July 1996). "The mammalian single-minded (SIM) gene: mouse cDNA structure and diencephalic expression indicate a candidate gene for Down syndrome".
949:, band 22.2. Based on the mapping position, its potential function as transcriptional repressor and similarity to Drosophila sim, it is proposed that SIM2 may contribute to some specific Down syndrome phenotypes
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Yamaki A, Tochigi J, Kudoh J, Minoshima S, Shimizu N, Shimizu Y (May 2001). "Molecular mechanisms of human single-minded 2 (SIM2) gene expression: identification of a promoter site in the SIM2 genomic sequence".
1167:"Physical mapping of the holoprosencephaly critical region in 21q22.3, exclusion of SIM2 as a candidate gene for holoprosencephaly, and mapping of SIM2 to a region of chromosome 21 important for Down syndrome"
2345:
2020:
Dahmane N, Ghezala GA, Gosset P, Chamoun Z, Dufresne-Zacharia MC, Lopes C, et al. (February 1998). "Transcriptional map of the 2.5-Mb CBR-ERG region of chromosome 21 involved in Down syndrome".
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2116:"Differential activities of murine single minded 1 (SIM1) and SIM2 on a hypoxic response element. Cross-talk between basic helix-loop-helix/per-Arnt-Sim homology transcription factors"
1367:"Differential activities of murine single minded 1 (SIM1) and SIM2 on a hypoxic response element. Cross-talk between basic helix-loop-helix/per-Arnt-Sim homology transcription factors"
1000:
There are three states of the gene: +/+, +/-, and -/-. When the gene is expressed as SIM2 -/-, it is considered disrupted and many physical malformations are seen, particularly in the
2289:"Identification of a novel basic helix-loop-helix-PAS factor, NXF, reveals a Sim2 competitive, positive regulatory role in dendritic-cytoskeleton modulator drebrin gene expression"
1318:"Identification of a novel basic helix-loop-helix-PAS factor, NXF, reveals a Sim2 competitive, positive regulatory role in dendritic-cytoskeleton modulator drebrin gene expression"
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1031:, causing the belly to be distended. It is thought that the over-expression of the SIM2 gene brings about some of the phenotypic deformities that are characteristic of
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1651:"Loss of singleminded-2s in the mouse mammary gland induces an epithelial-mesenchymal transition associated with up-regulation of slug and matrix metalloprotease 2"
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There are two known isoforms of SIM2 which play different roles in various tissues. The isoform SIM2 Short (SIM2s) has been shown to be specifically expressed in
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1860:
Osoegawa K, Okano S, Kato Y, Nishimura Y, Soeda E (June 1996). "A 19-kb CpG island associated with single-minded gene 2 in Down syndrome chromosomal region".
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1936:"Cloning of two human homologs of the Drosophila single-minded gene SIM1 on chromosome 6q and SIM2 on 21q within the Down syndrome chromosomal region"
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Shamblott MJ, Bugg EM, Lawler AM, Gearhart JD (August 2002). "Craniofacial abnormalities resulting from targeted disruption of the murine Sim2 gene".
7330:
7789:
4129:
1901:"Two murine homologs of the Drosophila single-minded protein that interact with the mouse aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein"
1277:"Two murine homologs of the Drosophila single-minded protein that interact with the mouse aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator protein"
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Deyoung MP, Scheurle D, Damania H, Zylberberg C, Narayanan R (2003). "Down's syndrome-associated single minded gene as a novel tumor marker".
1704:"Down syndrome-critical region contains a gene homologous to Drosophila sim expressed during rat and human central nervous system development"
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2051:"Mild impairment of learning and memory in mice overexpressing the mSim2 gene located on chromosome 16: an animal model of Down's syndrome"
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Chen H, Chrast R, Rossier C, Gos A, Antonarakis SE, Kudoh J, et al. (May 1995). "Single-minded and Down syndrome?".
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50:, HMC13F06, HMC29C01, SIM, bHLHe15, single-minded family bHLH transcription factor 2, SIM bHLH transcription factor 2
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Meng X, Shi J, Peng B, Zou X, Zhang C (April 2006). "Effect of mouse Sim2 gene on the cell cycle of PC12 cells".
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in many parts of the brain known to show deformities in individuals with Down syndrome, as well as in the
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2172:"Identification of Down's syndrome critical locus gene SIM2-s as a drug therapy target for solid tumors"
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1979:"The murine Sim-2 gene product inhibits transcription by active repression and functional interference"
1408:"The murine Sim-2 gene product inhibits transcription by active repression and functional interference"
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1591:"The bHLH/PAS transcription factor singleminded 2s promotes mammary gland lactogenic differentiation"
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Scientists can purposefully "knockout" or cause the gene to be disrupted. To do this, they perform
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Muenke M, Bone LJ, Mitchell HF, Hart I, Walton K, Hall-Johnson K, et al. (November 1995).
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Dahmane N, Charron G, Lopes C, Yaspo ML, Maunoury C, Decorte L, et al. (September 1995).
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Laffin B, Wellberg E, Kwak HI, Burghardt RC, Metz RP, Gustafson T, et al. (March 2008).
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Chrast R, Scott HS, Chen H, Kudoh J, Rossier C, Minoshima S, et al. (June 1997).
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Ema M, Ikegami S, Hosoya T, Mimura J, Ohtani H, Nakao K, et al. (August 1999).
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of midline cells in the central nervous system. SIM2 maps within the so-called
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Probst MR, Fan CM, Tessier-Lavigne M, Hankinson O (February 1997).
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Probst MR, Fan CM, Tessier-Lavigne M, Hankinson O (February 1997).
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2473:
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2458:
1089:
1052:
942:
1548:
Metz RP, Kwak HI, Gustafson T, Laffin B, Porter WW (April 2006).
557:
553:
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2436:
2431:
2426:
2416:
1068:
1036:
976:, which in turn inhibits the cell's ability to pass through the
915:
899:
63:
7503:
6832:
5074:
3574:
2376:
2334:
2287:
Ooe N, Saito K, Mikami N, Nakatuka I, Kaneko H (January 2004).
1316:
Ooe N, Saito K, Mikami N, Nakatuka I, Kaneko H (January 2004).
402:
7374:
7003:
6993:
6873:
6269:
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3158:
3148:
3143:
2935:
2930:
1004:
area. Individuals with SIM2 -/- have either a full or partial
1084:
and eliminate the predicted start codon and the following 47
1027:
death. Severe aerophagia leads to accumulation of air in the
906:
midline as well as the construction of the face and head.
508:
negative regulation of transcription by RNA polymerase II
2252:
Yamaki A, Kudoh J, Shimizu N, Shimizu Y (January 2004).
1210:"Entrez Gene: SIM2 single-minded homolog 2 (Drosophila)"
218:
1589:
Wellberg E, Metz RP, Parker C, Porter WW (March 2010).
383:
1092:
restriction site is introduced into the chromosome.
7622:
7582:
7551:
7516:
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2711:
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809:
784:
758:
733:
538:
negative regulation of transcription, DNA-templated
1977:Moffett P, Reece M, Pelletier J (September 1997).
1406:Moffett P, Reece M, Pelletier J (September 1997).
1108:
1106:
1104:
902:. It plays a major role in the development of the
165:
513:regulation of transcription by RNA polymerase II
2170:DeYoung MP, Tress M, Narayanan R (April 2003).
16:Protein-coding gene in the species Homo sapiens
1067:tissue. SIM2s is a splice variant which lacks
963:Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator
7765:transcription factor/coregulator deficiencies
6836:β-Scaffold factors with minor groove contacts
2346:
8:
1227:
1225:
1223:
1221:
1219:
1113:GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000159263
7513:
7500:
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2331:
568:
503:regulation of transcription, DNA-templated
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103:
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1341:
1292:
1182:
436:DNA-binding transcription factor activity
1204:
1202:
941:chromosomal region, specifically on the
1100:
968:When the SIM2 gene is transfected into
20:
1644:
1642:
1640:
1638:
1636:
1634:
1502:
1500:
1498:
1496:
1494:
170:
129:
124:
7:
2114:Woods SL, Whitelaw ML (March 2002).
1825:Molecular and Cellular Neurosciences
1365:Woods SL, Whitelaw ML (March 2002).
1011:and malformations in the tongue and
3519:(1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
2120:The Journal of Biological Chemistry
1905:The Journal of Biological Chemistry
1554:The Journal of Biological Chemistry
1371:The Journal of Biological Chemistry
1281:The Journal of Biological Chemistry
441:protein heterodimerization activity
1171:American Journal of Human Genetics
806:
781:
755:
730:
708:
689:
663:
644:
618:
599:
498:multicellular organism development
388:
306:
244:
223:
14:
895:that in humans is encoded by the
1023:, or the swallowing of air, and
392:
154:
147:
141:
116:
7506:(0) Other transcription factors
6790:transcriptional enhancer factor
2407:Activating transcription factor
523:embryonic pattern specification
7790:PAS-domain-containing proteins
2293:Molecular and Cellular Biology
1983:Molecular and Cellular Biology
1655:Molecular and Cellular Biology
1412:Molecular and Cellular Biology
1322:Molecular and Cellular Biology
933:that is a master regulator of
403:More reference expression data
372:More reference expression data
1:
6720:Interferon regulatory factors
4959:(2.5) Alternating composition
4155:General transcription factors
2305:10.1128/MCB.24.2.608-616.2004
2237:10.1016/S0304-3835(03)00409-9
2099:10.1016/S0378-1119(01)00450-4
1334:10.1128/MCB.24.2.608-616.2004
446:protein dimerization activity
139:
7785:Genes on human chromosome 21
6005:Octamer transcription factor
2713:(1.2) Basic helix-loop-helix
1469:10.1016/j.cellbi.2005.11.012
1019:. These malformations cause
528:transcription, DNA-templated
2779:Myogenic regulatory factors
7806:
2271:10.1016/j.bbrc.2003.11.168
1457:Cell Biology International
543:nervous system development
284:superior surface of tongue
7760:
7512:
7499:
6842:
6828:
6599:(3.5) Tryptophan clusters
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5070:
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3570:
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2372:
1148:"Mouse PubMed Reference:"
1130:"Human PubMed Reference:"
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138:
115:
106:
102:
57:
54:
44:
37:
32:
28:
23:
7420:(4.10) Cold-shock domain
2055:Human Molecular Genetics
1082:homologous recombination
2366:intracellular receptors
2197:10.1073/pnas.0831000100
1729:10.1073/pnas.92.20.9191
1035:. The presence of SIM2
957:SIM2 has been shown to
889:Single-minded homolog 2
832:Chr 21: 36.7 – 36.75 Mb
346:vastus lateralis muscle
276:vastus lateralis muscle
2133:10.1074/jbc.M110752200
2034:10.1006/geno.1997.5146
1918:10.1074/jbc.272.7.4451
1884:10.1093/dnares/3.3.175
1837:10.1006/mcne.1996.0001
1807:10.1006/geno.1996.0332
1567:10.1074/jbc.m508858200
1384:10.1074/jbc.M110752200
1294:10.1074/jbc.272.7.4451
1234:Developmental Dynamics
1029:gastrointestinal tract
904:central nervous system
338:triceps brachii muscle
7129:TATA-binding proteins
2362:Transcription factors
1995:10.1128/mcb.17.9.4933
1526:10.1093/carcin/bgl122
1424:10.1128/mcb.17.9.4933
132:Chromosome 21 (human)
2068:10.1093/hmg/8.8.1409
1667:10.1128/mcb.01701-07
931:transcription factor
518:cell differentiation
354:gastrocnemius muscle
7624:(0.6) Miscellaneous
7155:High-mobility group
6851:Rel homology region
3841:Testicular receptor
3582:DNA-binding domains
2188:2003PNAS..100.4760D
2151:Anticancer Research
2126:(12): 10236–10243.
1720:1995PNAS...92.9191D
1560:(16): 10839–10848.
1377:(12): 10236–10243.
1013:pterygoid processes
334:submandibular gland
6989:p53 p63 p73 family
6562:Heat shock factors
1952:10.1101/gr.7.6.615
1607:10.1242/dev.041657
1246:10.1002/dvdy.10116
1059:SIM2 Short (SIM2s)
1043:, oral and tongue
673:ENSMUSG00000062713
491:Biological process
465:Cellular component
429:Molecular function
264:buccal mucosa cell
7772:
7771:
7756:
7755:
7752:
7751:
7495:
7494:
7491:
7490:
6824:
6823:
6820:
6819:
6066:
6065:
5706:
5705:
5066:
5065:
5062:
5061:
4054:
4053:
3910:Mineralocorticoid
3566:
3565:
3562:
3561:
3266:
3265:
2379:(1) Basic domains
2157:(6A): 3149–3157.
1714:(20): 9191–9195.
986:inhibitor protein
886:
885:
882:
881:
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302:
201:
200:
7797:
7596:-related factors
7514:
7501:
7402:(4.9) Grainyhead
6844:
6830:
6782:(3.6) TEA domain
6072:(3.2) Paired box
5713:
5447:
5441:
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5129:
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5080:Helix-turn-helix
5072:
4034:
4014:
3989:
3952:
3922:Estrogen related
3871:
3767:
3615:
3608:
3596:Nuclear receptor
3589:
3572:
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2332:
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