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Comparison of force-field implementations

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This is a table of notable computer programs implementing
606:
Comparison of software for molecular mechanics modeling
586:
List of software for Monte Carlo molecular modeling
93:94, 96, 99SB, 03, GS, ii, Automatic FF generator 418:89, 94, 99, also with Extended Hückel Theory 8: 300:Full MMFF94, but code rumored unmaintained 18:Comparison of force field implementations 568:Plus custom fields for hires refinement 405:* in standard distribution since v4.5.0 38: 622: 7: 25: 630:Automatic Force Field generator 1: 309:* in standard distribution 685: 611:Molecular modeling on GPU 596:Molecular design software 659:Force fields (chemistry) 581:Force field (chemistry) 669:Software comparisons 664:Molecular modelling 591:Molecular mechanics 31:molecular mechanics 572: 571: 536:organic molecules 163:Ascalaph Designer 16:(Redirected from 676: 643: 638: 632: 627: 374:field available 39: 21: 684: 683: 679: 678: 677: 675: 674: 673: 649: 648: 647: 646: 639: 635: 628: 624: 619: 601:Molecule editor 577: 550:94, 96, 99, 03 512:94, 96, 98, 99 297:Via CHARMM-GUI 143:tool since v11 23: 22: 15: 12: 11: 5: 682: 680: 672: 671: 666: 661: 651: 650: 645: 644: 633: 621: 620: 618: 615: 614: 613: 608: 603: 598: 593: 588: 583: 576: 573: 570: 569: 566: 563: 560: 557: 554: 551: 548: 545: 539: 538: 528: 525: 522: 519: 516: 513: 510: 507: 501: 500: 494: 491: 488: 485: 482: 479: 476: 473: 467: 466: 464: 461: 458: 455: 452: 449: 446: 443: 437: 436: 434: 431: 428: 425: 422: 419: 416: 413: 407: 406: 403: 400: 397: 394: 391: 388: 385: 382: 376: 375: 369: 366: 363: 360: 357: 354: 351: 348: 341: 340: 338: 335: 332: 329: 326: 323: 320: 317: 311: 310: 307: 304: 301: 298: 295: 292: 289: 286: 280: 279: 277: 274: 271: 268: 265: 262: 259: 256: 250: 249: 246: 243: 240: 237: 234: 231: 228: 225: 219: 218: 216: 213: 210: 207: 204: 201: 198: 195: 189: 188: 186: 183: 180: 177: 174: 171: 168: 165: 159: 158: 156: 153: 150: 147: 144: 137: 134: 131: 125: 124: 113: 106: 103: 100: 97: 94: 91: 88: 82: 81: 78: 73: 70: 65: 60: 55: 50: 45: 24: 14: 13: 10: 9: 6: 4: 3: 2: 681: 670: 667: 665: 662: 660: 657: 656: 654: 642: 637: 634: 631: 626: 623: 616: 612: 609: 607: 604: 602: 599: 597: 594: 592: 589: 587: 584: 582: 579: 578: 574: 567: 564: 561: 558: 555: 552: 549: 546: 544: 541: 540: 537: 533: 529: 526: 523: 520: 517: 514: 511: 509:UA, AA, AA/L 508: 506: 503: 502: 499: 495: 492: 489: 486: 483: 480: 477: 474: 472: 469: 468: 465: 462: 459: 456: 453: 450: 447: 444: 442: 439: 438: 435: 432: 429: 426: 423: 420: 417: 414: 412: 409: 408: 404: 401: 398: 395: 392: 389: 386: 383: 381: 378: 377: 373: 370: 367: 364: 361: 358: 355: 352: 349: 346: 343: 342: 339: 336: 333: 330: 327: 324: 321: 318: 316: 313: 312: 308: 305: 302: 299: 296: 293: 290: 287: 285: 282: 281: 278: 275: 272: 269: 266: 263: 260: 257: 255: 252: 251: 247: 244: 241: 238: 235: 232: 229: 226: 224: 221: 220: 217: 214: 211: 208: 205: 202: 199: 196: 194: 191: 190: 187: 184: 181: 178: 175: 172: 170:94, 99SB, 03 169: 166: 164: 161: 160: 157: 154: 151: 148: 145: 142: 138: 135: 132: 130: 127: 126: 122: 118: 114: 111: 107: 104: 101: 98: 95: 92: 89: 87: 84: 83: 79: 77: 74: 71: 69: 66: 64: 61: 59: 56: 54: 51: 49: 46: 44: 41: 40: 37: 35: 32: 27: 19: 636: 625: 248:MMFF94-like 140: 112:-like field 34:force fields 28: 26: 498:biopolymers 347:mm utility 653:Categories 641:CHARMM-GUI 617:References 123:, ligands 80:Comments 575:See also 532:proteins 372:Dreiding 345:Gaussian 209:94, 94s 193:Avogadro 117:proteins 110:Dreiding 515:19, 27 421:22, 27 380:GROMACS 315:Gabedit 223:Balloon 141:chamber 86:Abalone 43:Program 543:Yasara 505:Tinker 427:94(s) 284:CHARMM 72:QVBMM 58:CHARMM 390:Yes* 387:Yes* 294:Yes* 291:Yes* 288:Yes* 129:AMBER 53:AMBER 530:For 496:For 481:Yes 478:Yes 475:Yes 454:Yes 451:Yes 448:Yes 445:Yes 441:NAMD 393:Yes 384:Yes 368:Yes 353:Yes 331:Yes 328:Yes 322:Yes 258:Yes 254:BOSS 215:Yes 206:Yes 146:Yes 139:Via 136:Yes 133:Yes 115:For 108:UFF- 68:MMFF 63:GAFF 48:OPLS 565:No 562:No 559:No 556:No 553:No 547:No 527:No 524:No 521:94 518:No 493:No 490:No 487:No 484:No 463:No 460:No 457:No 433:No 430:No 424:No 415:AA 411:MOE 402:No 399:No 396:No 365:No 362:No 359:No 356:No 350:No 337:No 334:No 325:No 319:No 306:No 303:No 276:No 273:No 270:No 267:No 264:No 261:No 245:No 242:No 239:94 236:No 233:No 230:No 227:No 212:No 203:No 200:No 197:No 185:No 182:No 179:No 176:No 173:No 167:UA 155:No 152:No 149:No 121:DNA 105:No 102:No 99:No 96:No 90:UA 76:UFF 36:. 655:: 534:, 119:, 471:Q 20:)

Index

Comparison of force field implementations
molecular mechanics
force fields
Program
OPLS
AMBER
CHARMM
GAFF
MMFF
UFF
Abalone
Dreiding
proteins
DNA
AMBER
Ascalaph Designer
Avogadro
Balloon
BOSS
CHARMM
Gabedit
Gaussian
Dreiding
GROMACS
MOE
NAMD
Q
biopolymers
Tinker
proteins

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