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Small nucleolar RNA J33

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1896: 141: 26: 177:
class of snoRNAs which contain the conserved sequence motifs known as the C box (UGAUGA) and the D box (CUGA). Most of the members of the box C/D family function in directing site-specific 2'-O-
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Galardi, S.; Fatica, A.; Bachi, A.; Scaloni, A.; Presutti, C.; Bozzoni, I. (October 2002).
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of the eukaryotic cell which is a major site of snRNA biogenesis. It is known as a
178: 173:(snoRNA) and also often referred to as a guide RNA. snoRNA J33 belongs to the 307: 166: 101: 288: 239: 270: 319: 174: 170: 25: 181:
of substrate RNAs. Plant snoRNA J33 was identified in a screen of
62: 311: 80: 57: 323: 165:(snRNAs). This type of modifying RNA is usually located in the 161:(ncRNA) molecule which functions in the modification of other 74: 253:
Chen CL, Liang D, Zhou H, Zhuo M, Chen YQ, Qu LH (2003).
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168: 164: 160: 156: 152: 143: 140: 137: 133: 130: 127: 125: 121: 118: 115: 112: 110: 106: 103: 100: 98: 94: 90: 86: 82: 79: 76: 72: 67: 64: 61: 59: 55: 51: 47: 42: 37: 33: 27: 22: 17: 1916:expanding it 1908:cell biology 1901: 1886: 1876:Trypanosomal 1851:F1/F2/snoR5a 1685:Z157/R69/R10 1675:Z152/R70/R12 925:64/10 family 369: 316: 262: 258: 248: 213: 207: 197: 183:Oryza sativa 182: 154: 148: 1660:118/121/120 584:31/Z110/Z27 179:methylation 44:Identifiers 1955:Categories 1856:Pyrococcal 467:28S-Gm3113 462:28S-Gm1083 457:28S-Cm3227 452:28S-Cm2645 442:28S-Am2634 437:28S-Am2589 427:18S-Um1356 422:18S-Gm1358 189:References 138:structures 129:SO:0000593 117:GO:0005730 114:GO:0006396 69:Other data 30:Predicted 1904:molecular 1477:61/Z1/Z11 589:32/81/Z41 472:28S-U3344 447:28S-Cm788 432:28S-Am982 167:nucleolus 102:Eukaryota 97:Domain(s) 38:of snoJ33 1690:Z159/U59 1650:Z107/R87 1635:Z102/R77 1590:13/snr52 518:28S-3327 513:28S-3316 508:28S-2876 503:28S-1192 498:18S-1854 493:18S-1377 406:MBII-202 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Index


secondary structure
sequence conservation
Rfam
RF00315
RNA
Gene
snRNA
snoRNA
Domain(s)
Eukaryota
GO
GO:0006396
GO:0005730
SO
SO:0000593
PDB
PDBe
molecular biology
non-coding RNA
small nuclear RNAs
nucleolus
small nucleolar RNA
C/D box
methylation
"Purified Box C/D snoRNPs Are Able to Reproduce Site-Specific 2'-O-Methylation of Target RNA in Vitro"
Molecular and Cellular Biology
doi
10.1128/MCB.22.19.6663-6668.2002
PMC

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